Al igual que con las llamadas telefónicas normales, las llamadas de WhatsApp también permanecen almacenadas en el registro de llamadas, a menos que haga algo para evitarlo. Si por alguna razón no desea que aparezca ninguna llamada de WhatsApp en la lista, puede eliminarla selectivamente. Del mismo modo, WhatsApp te facilita eliminar todos los registros de llamadas de un solo golpe.

Eliminar algunas llamadas de WhatsApp: Si desea eliminar el registro de llamadas de algunas de las llamadas, la buena noticia es que puede seleccionar exactamente cuáles desea eliminar. Para hacer esto, vaya a la pestaña de Llamadas de WhatsApp y haga un toque prolongado en las que desea eliminar.
Esto activará el modo de selección, en el que puede seleccionar otras llamadas tocándolas (toque simple). Cuando haya terminado de seleccionar, toque el icono de la papelera para borrarlos «No hay confirmación» se eliminan sin más.
Eliminar todas las llamadas de WhatsApp
Si desea borrar absolutamente todas las llamadas incluidas en el registro de llamadas de WhatsApp, la buena noticia es que no necesita realizar el paso anterior para seleccionarlas todas. En su lugar, use el menú y elija Eliminar registro de llamadas.
En este caso, debe confirmar sus intenciones en la ventana. Por el momento, WhatsApp no le da la opción de no guardar el registro de llamadas, por lo que debe repetir estos pasos periódicamente si desea mantenerlo vacío.
Origen: Cómo eliminar el registro de llamadas de WhatsApp – Asap Land